RESEÑA HISTÓRICA DE LA INSTITUCIÓN
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Creada en el año 1963, como de Escuela Normal de Varones, actuando como Rector el Señor Diego Mario Vanegas Ulloa.
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En 1965 se anexó el Quinto de Primaria.
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En el año 1966 se cambio la razón social a Colegio Departamental de Bachillerato Mixto y se inician obras para la construcción de la planta física con auxilios municipales y departamentales.
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En el año 1973 se logra aprobación de estudios de 1 a 6 Bachillerato, sale la primera promoción de Bachilleres integrada por 12 alumnos y se termina la segunda planta del colegio.
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Año tras año se va logrando la dotación para laboratorios y se continua construyendo planta física.
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En el año 1983 el colegio se inscribe al CASD de Tunja
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En 1984 sale la primera promoción de Bachilleres diversificados.
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Se continúa adscrito al CASD hasta 1988 y a partir de 1989 nuevamente el colegio saca sólo Bachilleres académicos.
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En el año 1986 cambia la razón social del plantel a Colegio Nacionalizado por Acuerdo No. 069.
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En el año 1993 se anexa como Jornada Nocturna el Colegio Cooperativo Bolivariano de Bachillerato Nocturno por Acuerdo 174 de 1993.
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En el año 1994 se inicia la diversificación en el plantel en el grado 10 modalidades de Ciencias Naturales y Comercio.
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En este mismo año sale la última promoción de Bachilleres académicos.
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A partir del año 2002 se fusiona la Sección Primaria urbana al plantel.
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Durante su administración han pasado por la Rectoría el Profesor DIEGO MARIO VANEGAS ULLOA de 1964 hasta 1969.
EUCLIDES CAMPOS ROJAS de 1970 hasta 1975.
GUILLERMO MARIÑO MARTINEZ de 1975 a 1977.
EDUARDO CORTES HIGUERA de 1978 a 1985.
GLORIA ALFONSO DE JAIMES de 1985 hasta 1987.
GERMAN SUAREZ MARTINEZ de 1987 hasta 2004.
Lic. LUIS ARTURO CORREDOR BERNAL. de 30 de julio 2004 Hasta el 2011,
a partir del 20 de enero de 2011 la Mgs MARTHA LUCIA GOMEZ AVELLANEDA.
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A partir del año 2008 el Colegio Nacionalizado, cambia su razón social por el de INSTITUCIÓN EDUCATIVA “FRANCISCO DE PAULA SANTANDER”, en virtud a la fusión establecida por la Secretaría de Educación de Boyacá de cinco sedes rurales: Montoya, Mata-negra, Sota, El Hato y San Pedro.
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A finales del mismo año, se obtiene la aprobación de una nueva especialidad técnica en electrónica mediante Resolución Nº 003115 de Octubre 27 de 2009.